黄果树大瀑布的成因要上溯至2亿多年前的中三叠纪，那时黄果树一带沉积了一套巨厚的碳酸盐岩。黄果树瀑布发育在一套“中三叠世中统关岭二段中厚层夹少量薄层状云灰岩”中，位置在翁寨小背斜东翼。黄果树瀑布形成时期白水河，是条发育于距今10—50万年之间，第四纪、晚更新世时期由“宽谷期”向“峡谷期”演中的地上河，后因“喜拉雅运动”时期地壳多次歇抬，引起河流侵蚀基面下降，导致河流侵蚀、溶蚀下切作用加，在该处形成“裂”（河床因地壳抬生、侵蚀基准下降及构造、岩性因素影响而发生较大转折处），这个裂点处裂隙、溶洞、暗河常发育。白水河先形成一个喀斯特侵蚀裂型的水洞型瀑布，后来随着河侵蚀、溶蚀、侧蚀作用在地壳间歇抬升及晚更世后期温湿候中，水动力逐渐加大等因素影响下，水洞洞顶逐步坍塌，黄树大瀑布终呈现，已经有5万年的历史。